Um experimento de imunofluorescência é baseado nas seguintes etapas principais:
1. Anticorpos específicos se ligam à proteína de interesse.
2. Corantes fluorescentes são acoplados a esses complexos imunes para visualizar a proteína de interesse usando microscopia.
Distingue-se entre imunofluorescência direta e indireta. Na imunofluorescência direta, o anticorpo primário é acoplado diretamente a um fluoróforo (também chamado de fluorocromo), permitindo fácil manuseio e visualização rápida. Na imunofluorescência indireta, um anticorpo secundário acoplado ao fluoróforo, que se liga especificamente ao anticorpo primário, é usado para visualizar a estrutura de interesse.
Embora a segunda abordagem seja mais demorada do que a imunofluorescência direta, ela tem várias grandes vantagens, como geralmente é mais barata, porque o anticorpo secundário pode ser usado para diferentes anticorpos primários. Além disso, várias proteínas podem ser especificamente visualizadas em paralelo em uma única amostra (imunofluorescência multicolorida) combinando vários anticorpos primários com anticorpos secundários específicos - cada um deles marcado com um fluoróforo diferente.
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